厦门市第二医院海沧医院始建于1995年，医院总占地面积34265平方米，其中一期已建设完成门诊楼、住院楼、食堂、供应室各一栋，占地面积约24000平方米，建筑面积16783平方米，二期预留用地约1万平方米。根据市委市政府的决定，1998年厦门市第二医院与海沧医院合并。历经十年的建设发展，海沧医院已从一家仅有16名工作人员普通医院，成长为拥有152张床位编制、职工370余名的重点院区。部分特色科室在厦门乃至闽南地区享有盛誉。
2007年，海沧医院住院病人数达6456人次，门诊量达210718人次，日均门诊量1000多人次，日均住院病人近300人次。住院及门诊病人数量已远远超出1995年海沧医院建设时所预计的150张床位、日均门诊量300~500人次的容量。
海沧医院目前开设内科、外科、骨神经科、妇科、产科、儿科、肿瘤科等7个带住院病区科室，常年开设急诊科、内科、外科、骨神经科、妇科、产科、儿科、肿瘤科、泌尿外科、皮肤科、口腔科、肾内科、理疗科、中医科、消化内镜诊疗部、体检部等16个门诊科室，开设放射科、ct室、b超室、心电图室、检验科、药房、供应室、手术室等8个辅助科室。拥有双排全身螺旋ct、柯达数字x光机(dr)、超细电子口鼻胃镜、腔镜全套手术器械、后路椎间盘镜、超声刀、外科手术工作站、贝克曼全自动生化仪等价值约3700余万元的先进医疗设备。
骨科拥有先进、齐全的骨科治疗手术器械，手术种类和手术能力达三级甲等医院水平，成功地开展了大量的高难度、高风险的手术。开展的小儿脑瘫脊神经后根选择性切断术为省内唯一。